Khảo sát sự tương tác của một vài chất ức chế enzyme Histone deacetylase : Luận văn tốt nghiệp Cao học ngành: Hóa hữu cơ

Phần mềm AutoDock đã được sử dụng rộng rãi trong nghiên cứu kết nối protein-phối tử. Trong nghiên cứu này, AutoDock 4 và AutoDock Vina đã được ứng dụng để chọn lọc các hợp chất ức chế enzyme histone deacetylase 8 (HDAC8). Trong quá trình này, 8 th...

全面介紹

Đã lưu trong:
書目詳細資料
主要作者: Phạm, Thị Kim Huê
格式: 圖書
語言:Undetermined
出版: Cần Thơ Trường Đại học Cần Thơ 2020
主題:
標簽: 添加標簽
沒有標簽, 成為第一個標記此記錄!
Thư viện lưu trữ: Trung tâm Học liệu Trường Đại học Cần Thơ
實物特徵
總結:Phần mềm AutoDock đã được sử dụng rộng rãi trong nghiên cứu kết nối protein-phối tử. Trong nghiên cứu này, AutoDock 4 và AutoDock Vina đã được ứng dụng để chọn lọc các hợp chất ức chế enzyme histone deacetylase 8 (HDAC8). Trong quá trình này, 8 thuốc đã biết (Vorinostat, Belinostat, Panobinostat, Trichostatin A, Dacinostat, Givinostat, Pracinostat, Oxamflatin), cùng với 24 dẫn xuất hydroxamic acid được chọn để khảo sát sự tương tác với enzyme HDAC8 (PDB ID: 1T67). Năng lượng liên kết tự do được xác định bằng cách sử dụng phương pháp gắn kết tự động với thuật toán di truyền Lamarckian (LGA). Phần mềm Discovery Studio Visualizer được sử dụng để phân tích các tương tác chính như liên kết hydrogen, vùng kỵ nước, tương tác pi-stacking với hướng hoạt động của các amino acid thơm. Dựa trên kết quả gắn kết, hầu hết các hợp chất đều cho thấy tương tác tốt và tạo liên kết hydrogen ở vị trí hoạt động của enzyme HDAC8. Đặc biệt, 6 hợp chất (VRNT4, BLNT6, BLNT7, BLNT8, BLNT9 và PNBNT4) được chọn là chất ức chế HDAC8 tốt nhất. Do đó, nghiên cứu này đánh dấu cho việc tìm kiếm các chất ức chế phân tử nhỏ mới và mạnh của enzyme HDAC8. Hơn nữa, chiến lược này cũng có thể được sử dụng để khảo sát các chất ức chế HDAC khác như một mục tiêu của liệu pháp điều trị ung thư